用药医嘱/处方审核、医院制剂配制、静脉用药配置、药品调剂发放、用药监测及用药监护、药源性疾病识别及处置、药品不良事件上报及分析；此外，还有药品采购供应、药事管理、药学科研、药学教学及培训的职责。
通过用药咨询、处方（医嘱）前置审核、互联网+药学服务、医药联合门诊、药学科普、合理用药讲座、药师驻科、药学查房、药学会诊、患者用药监护和用药教育等工作，促进儿科患者安全、有效地使用药品和提高医院及医护人员合理用药水平。在儿科个体化药物治疗、全周期用药安全及药物警戒、药学服务信息化等方面具有较大的国内影响力。
两江院区：
门诊楼1楼E区-门诊药房、中药房
门诊楼3楼B区-输液药房
感染楼1楼-发热药房
住院医技楼LG层-住院药房、PIVAS、治疗药物监测室、药库、临床药学室、临床药学培训基地学员办公室；
渝中院区：
1号楼1楼-门诊药房
1号楼5楼-特需药房
3号楼2楼-制剂室、药库
3号楼3楼-输液药房
3号楼4楼-中药房
6号楼1楼-住院药房、PIVAS
7号楼3楼-临床药学室、药物分析室
