儿科学院于1956年由上海第一医学院儿科系全迁来渝创建，是中国最早建立的四大儿科系之一，历经七十年年薪火相传，拥有完整的国家级医-教-研儿科高层次人才培养平台，连续五年位居中国大学本科教育专业排行榜儿科专业第一位。学院是国内最早的儿科学硕士（1981年）和博士（1990年）学位授予点、博士后流动站（1995年）。拥有教育部高等学校教学指导委员会儿科分会副主任委员、中华医学会儿科学分会和小儿外科学分会副主委、中华预防医学会儿童保健分会副主任委员单位；《中华儿科杂志中华小儿外科杂志》杂志副总编、副主编单位；国家规划教材《儿科学》第六版主编和第七、八版副主编单位，国家规划教材《小儿外科学》第四版、第五版、第六版主编单位。附属儿童医院是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，连续14年位居全国儿童医院综合排名前三，小儿内、外科专科声誉稳居全国第三，11个专科获评国家临床重点专科。国家儿童健康与疾病临床医学研究中心、国家儿童区域医疗中心、国家发展改革委优质医疗资源输出单位，全国教育系统先进集体、教育部全国党建工作标杆院系，国家卫生健康委全国公立医院党建示范医院，全国文明单位。